碳是所有生命形式的基石，碳+氮+水+氧。 這些是肥料基本組成部分。

原料墊層碳（秸稈、稻殼）用作氮吸附和保持可溶性氮以及堆肥中存在的其他植物營養元素。
碳源材料為堆肥提供結構和孔隙度，使得我們的堆肥“呼吸”，促使氧氣在整個堆肥中移動。 如果沒有氧氣，有機物質分解過程將很快變為厭氧。
碳源材料提供了在堆肥過程中維持微生物生命所必需的碳水化合物。分解堆肥細菌是生命形式，也需要蛋白質和碳水化合物來生長和繁殖。糞便組分為微生物提供蛋白質（氮），碳源材料為微生物提供碳水化合物以維持其代謝過程。

畜禽糞便中的氮來源于飼料中的豆粕和腸道中的其他酶促反應。
最初，氮以尿素的形式非常容易溶解，當暴露在空氣中時，天然存在的尿素酶會將尿素轉化為氨氣（NH3）和N2氣體。氨是一種揮發性氣體。 如果沒有捕獲尿素和氨的機制，堆肥中自然產生的氮的大部分價值就會損失或浪費。
綠康好氧堆肥過程通過將可溶性和揮發性形式轉化為“有機”氮與有機碳結合并保持的氮，防止了有價值的氮肥的損失。當堆肥過程完成時，有機氮保持在分解微生物的細胞結構內。 氨氮不再存在 – 氣味減少了。現在可溶性氮已轉化為緩釋氮（SRN）。

當碳（原始有機物質）和氮氣充足時，好氧微生物開始快速生長和繁殖，并以有機質為食。 隨著微生物活動的增加，嗜熱微生物的代謝過程通過呼吸產生大量的生物熱。 這種熱量以水蒸氣的形式釋放。
微生物高度活躍，內部堆肥溫度為55至60攝氏度。

最終，堆溫將降低且料堆干燥，微生物分解（料堆中的生命形式）將開始減慢并最終停止。但是，這一速度的減慢不會被誤認為是穩定的堆肥。在整個過程中，必須反復添加水，這樣微生物群落才能完成徹底穩定的工作。
在綠康堆肥場的中收集到的降雨定期回收到料堆中。當堆肥保持在45%到55%之間濕度時，最佳堆肥繼續進行。低于45%的料堆活性將減緩堆肥過程。相反，含有過多水分的料堆會阻礙曝氣，并可能導致厭氧發生。